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arabette des dames (n.)

arabidopsis thaliana

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Arabette des dames

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<imagemap>Image:Gtk-dialog-info.svg|20px|Comment lire une taxobox

rect 0 0 50 50 Wikipédia:Lecture d'une taxoboxdesc none</imagemap> Arabette des dames

Arabidopsis thaliana
Classification classique
RègnePlantae
DivisionMagnoliophyta
ClasseMagnoliopsida
OrdreCapparales
FamilleBrassicaceae
GenreArabidopsis
Nom binominal
Arabidopsis thaliana
(L.) Heynh., 1842
Classification phylogénétique
OrdreBrassicales
FamilleBrassicaceae
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L'arabette des dames (Arabidopsis thaliana) est une plante appartenant à la famille des Brassicacées.

Autres noms communs : arabette de Thalius, Arabidopsis de Thalius, arabette rameuse, fausse arabette.

Fleurs

Sommaire

Description

Caractéristiques

données d'après : Julve, Ph., 1998 ff. - Baseflor. Index botanique, écologique et chorologique de la flore de France. Version : 23 avril 2004.

Intérêt scientifique

Cette plante est un organisme modèle pour la recherche génétique dans le monde végétal. En 2000 ce fut le premier génome végétal séquencé[1]. Les raisons de ce choix sont nombreuses :

  • petite taille, en laboratoire on peut cultiver un millier de pieds sur un mètre carré ;
  • cycle de développement court, le cycle graine → plante → graine ne dure que deux mois ;
  • un plant produit environ 40 000 graines ;
  • c'est un des plus petits génomes connus dans le monde végétal. Sa taille a initialement été estimée à 125 millions de paires de bases, réparties sur 5 chromosomes et 25 498 gènes ; mais une étude datée de 2003[2] montre que cette valeur a été sous-estimée et qu'elle serait en réalité de 0.16 picogramme par noyau cellulaire, soit environ 157 millions de paires de bases[3].
  • absence d'intérêts économiques sur cette espèce, cela facilite la diffusion des informations entre laboratoires.

Des recherches sont actuellement en cours pour permettre la détection de mines anti-personnel grâce à des graines d'Arabidopsis qui, après modification génétique, changeraient de couleur en cas de culture au-dessus d'une mine, ce qui en faciliterait la détection et l'élimination[4].

On a montré qu'une protéine (histone H2A.Z) est impliquée chez cette plante dans la détection de faibles variations de température (quelques degrés celsius). Cette protéine modifie l’enroulement de l’ADN sur lui-même et contrôle ainsi l’accès à l’ADN de certaines molécules inhibant ou activant la transcription de plusieurs dizaines de gènes. Cet effet « bio-thermostat » semble fréquent dans la nature, car également détecté chez la levure [5],[6]. Ceci devrait aider à mieux comprendre certains effets (sur les gènes) des variations climatiques.

Références

Sur les autres projets Wikimedia :

  1. (en) Arabidopsis Genome Initiative, « Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana », dans Nature, vol. 408, no 6814, 14 Dec 2000, p. 796-815 [résumé (page consultée le 14 décembre 2008)] 
  2. Bennett MD, Leitch IJ, Price HJ and Johnston JS. 2003. Comparisons with Caenorhabditis (~100 Mb) and Drosophila (~ 175 Mb) using flow cytometry show genome size in Arabidopsis to be ~157 Mb and thus ~25 % larger than the Arabidopsis Genome Initiative estimate of ~125 MB. Annals of Botany, 91: 547-557.
  3. Un picogramme équivaut à environ 978 millions de paires de bases, d'après Doležel, J., J. Bartoš, H. Voglmayr, and J. Greilhuber. 2003. Nuclear DNA content and genome size of trout and human. Cytometry 51A: 127-128.
  4. La plante qui détecte les mines.
  5. S.V. Kumar et P.A. Wigge, H2A.Z-containing nucleosomes mediate the thermosensory response in Arabidopsis, Cell, vol. 140, pp. 136-147, 2010
  6. Brève du journal Pour la Science (par Jean-Jacques Perrier, 2010/01/25)


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